Le CAP est organisé autour d'un Comité de coordination (CC), d'un secrétariat pour la Suisse et de deux groupes de travail, l'un en Suisse alémanique (AG DS, c'est à dire Arbeitsgruppe Deutschschweiz) et l'autre en Suisse romande (GT SR, c'est à dire Groupe de travail Suisse romand).

Si les deux groupes de travail ont chacun leur responsable, le CAP a une présidente en la personne de Zejnep Mejdi, pharmacienne responsable à la pharmacieplus de Vuadens. Zejnep Mejdi est membre du Groupe de travail Suisse romand du CAP depuis plusieurs années.